应用本科与高职专科相比也有较大的不同。尽管高职都是培养一线需要的技术应用人才，但应用本科出现以后，高职专科的具体培养目标和规格应当有所调整，与应用本科有所分工。高职专科主要培养一般企事业部门的技术应用型人才，尤其是培养大量一线需要的技术人才。应用本科则主要培养技术密集产业的高级技术应用型人才，并担负培养生产一线需要的管理者、组织者以及职业学校的师资等任务。
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